实验室定位：围绕淮河下游主要粮食作物生产重大科学问题及现代种业发展难题，开展农作物种质资源关键基因高效挖掘与育种应用技术研究，智能高效定向创制突破性农作物新种质（新品种），建成国际一流水准的作物种质创新实验室，科技赋能淮河下游地区农业高质量发展，为保障国家粮食安全做贡献。

重点研究内容：（一）拓宽淮河下游主要农作物遗传基础；（二）优异种质资源重要功能基因挖掘与育种价值评价；（三）稻麦前沿育种技术创新与分子设计育种。

拟解决重大问题：（一）淮河下游主推品种存在遗传基础狭窄、优异种质资源的育种利用率低等问题；（二）淮河下游稻麦生产穗颈瘟、赤霉病频发以及化肥农药过量施用等；稻麦品质难以满足市场高端消费需求；（三）淮河下游缺乏高产、优质、绿色高效、丰产性、广适性等综合性状协调的突破性品种。