国家耐盐碱水稻技术创新中心由袁隆平院士倡议创立，2021年3月，经科学技术部批复建设。按照“共商、共建、共治、共享、共用”原则，实行“总部、研究中心、区域中心”建设模式，中心由湖南杂交水稻研究中心牵头，联合国内科研院所（企业）12个单位共建。

国家耐盐碱水稻技术创新中心华东中心由江苏省农业科学院牵头建设。以聚集滨海盐碱地水稻种业创新为核心，以解决耐盐碱水稻产业前沿引领技术、“卡脖子”关键共性技术为突破口，以资源整合集成和体制机制创新为手段，联合区域内的盐城市农业科学院、连云港市农业科学院、扬州大学、中国水稻研究所、山东省农业科学院等8家高等院校和科研单位共建。立足华东区域，配合总部开展耐盐碱水稻新品种、新技术创新研究、展示和示范推广工作。